Мероприятия

Курс «Complex Trait Analysis of Next Generation Sequence Data»

Второй ежегодный курс по комплексному анализу Complex Trait Analysis of Next Generation Sequence Data будет проходить в Центре Макса Дельбрюка в Берлине 4-8 июля 2016 года. Цель курса - научить участников как теории, так и практическому применению методов анализа данных секвенирования следующего поколения (NGS) для изучения сложных признаков человека. Слушатели узнают, как осуществлять дизайн исследования, выбор вариантов из данных NGS, анализировать популяционные и семейные (анализ «троек) данные и проводить оценку функциональной значимости вариантов. Занятия будут проводиться с использованием различных компьютерных программ (GATK, IGV, Polyphen 2, PSEQ, Seapower, и Variant Association Tools (VAT)). Будут обсуждаться темы: выравнивание последовательности, выбор варианта из данных NGS, контроль качества данных NGS, основы тестирования ассоциаций для количественных и качественных признаков (фиксированные эффекты, случайные эффекты и смешанные модели), методы анализа ассоциаций редких вариантов, оценка мощности и размера выборки для исследования ассоциаций редких вариантов, оценка функциональности варианта.

Дополнительная информация на сайте:
https://statgen.research.bcm.edu/ComplexNGS2016/view